Программный комплекс PC-GAMESS/Firefly на СКИФ МГУ - "Чебышев"
Программный комплекс PC-GAMESS/Firefly разработан группой во главе с Александром Грановским на Химическом факультете МГУ. Официальная страница программы - http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/.
Для доступа к программе необходимо получить лицензию в порядке, описаном на сайте программы. Как правило, она бесплатна.
Для пользователей, имеющих лицензию, необходимо направить e-mail Александру Грановскому с просьбой пордтвердить её для работы на СКИФ-МГУ "Чебышёв".
Для запуска используйте команду:
cleo-submit -np NP /home/software/FF/firefly.mvapich -r -f -p -stdext -i /full/path/to/input.inp -o /full/path/to/output.inp
Здесь NP - число ядер. Вместо cleo-submit можно писать mpirun.
Перед использованием Firefly необходимо указать версию MPI командой mpi-selector:
mpi-selector --set mvapich-gcc-i586
После этого надо закрыть сессию на СКИФ и войти снова. Теперь можно пользоваться PG-GAMESS/Firefly до тех пор, пока не будет проведена смена версии MPI (т.е. не надо делать mpi-selector каждый раз).
Если Вы запускаете другие MPI-приложения, то перед их компиляцией и/или запуском обязательно смените версию MPI. Например на mvapich-intel-x86_64.
Внимательно изучите документацию на сайте программы PC-GAMESS/Firefly. Вопросы по использованию направляйте автору - Александру Грановскому (gran()classic.chem.msu.su).
Согласно лицензионному соглашению, копирование, дизассеблирование и подобные действия над программой PG-GAMESS/Firefly и её компонентами запрещены.
Перед работой с пакетом обязательно ознакомьтесь с информацией по пакету на этой страничке. Здесь приведены важные сведения по оптимизации производительности пакета.
