На суперкомпьютер установлена программа TURBOMOLE
Для запуска программы, предварительно, необходимо подготовить входные файлы. Подготовка входных файлов осуществляется программой define. Для запуска программы define необходимо определить переменную среды TURBODIR. Для этого в среде запуска задач (сервер с которого запускаются задачки) нужно выполнить команду:
export TURBODIR=/opt/software/TURBOMOLE
(для удобства данную команду можно записать в файл ~/.bashrc)
Далее, там же в среде запуска задач запустить интерактивную программу define и ввести в нее нужные параметры
/opt/software/TURBOMOLE/bin/em64t-unknown-linux-gnu/define
Программа define создаст входные файлы для дальнейших расчетов. Сами расчеты запускаются из той же директории, где и лежат созданные входные файлы.
Например, для мотода Хартри-Фока команда запуска расчетов такова:
sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/software/TURBOMOLE/run_slurm.sh dscf
для связанных кластеров:
sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/software/TURBOMOLE/run_slurm.sh ricc2
Для запуска расчетов установка MPI-окружения не требуется, (внимание: здесь не надо указывать скрипты запуска impi или mvapich, run_slurm.sh сам себе является скриптом запуска)