На суперкомпьютер установлена программа TURBOMOLE

Для запуска программы, предварительно, необходимо подготовить входные файлы. Подготовка входных файлов осуществляется программой define. Для запуска программы define необходимо определить переменную среды TURBODIR. Для этого в среде запуска задач (сервер с которого запускаются задачки) нужно выполнить команду:

export TURBODIR=/opt/software/TURBOMOLE

(для удобства данную команду можно записать в файл ~/.bashrc)

Далее, там же в среде запуска задач запустить интерактивную программу define и ввести в нее нужные параметры

/opt/software/TURBOMOLE/bin/em64t-unknown-linux-gnu/define

Программа define создаст входные файлы для дальнейших расчетов. Сами расчеты запускаются из той же директории, где и лежат созданные входные файлы.

Например, для мотода Хартри-Фока команда запуска расчетов такова:

sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/software/TURBOMOLE/run_slurm.sh dscf

для связанных кластеров:

sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/software/TURBOMOLE/run_slurm.sh ricc2

Для запуска расчетов установка MPI-окружения не требуется, (внимание: здесь не надо указывать скрипты запуска impi или mvapich, run_slurm.sh сам себе является скриптом запуска)