Специализированные параллельные библиотеки

Параллельные процедуры из областей линейной алгебры, сеточных методов, методов Монте-Карло, генетических алгоритмов, рендеринга изображений, квантовой и молекулярной химии и др., доступные для использования в пользовательских приложениях.

ATLAS, Aztec, BlockSolve95, Distributed Parallelization at CWP, DOUG, GALOPPS, JOSTLE, NAMD, P-Sparslib, PIM, ParMETIS, PARPACK, PBLAS, PETSc, PGAPack, PLAPACK, ScaLAPACK, SPRNG, другие, ссылки.

ATLAS

  • ATLAS (Automatically Tuned Linear Algebra Software) - библиотека, позволяющая автоматически генерировать и оптимизировать численное программное обеспечение для процессоров с многоуровневой организацией памяти и конвейерными функциональными устройствами. Базируется на BLAS 3 уровня (Level 3). ATLAS требует некоторого времени для изучения основных параметров архитектуры целевого компьютера, а затем на основе этих параметров получает "оптимальный" код.
  • Библиотека разработана в Argonne National Laboratory/MCS division. Распространяется бесплатно.

Aztec

  • Aztec - параллельная библиотека итерационных методов для решения систем линейных уравнений. Позволяет описывать части распределенной матрицы с использованием глобальной адресации.
  • Дополнительные ссылки: Раздел методического пособия (Ростовский университет).

BlockSolve95

  • Параллельная библиотека для решения разреженных систем линейных уравнений. Реализована с помощью MPI.
  • Библиотека разработана в Argonne National Laboratory/MCS division. Распространяется бесплатно.

Distributed Parallelization at CWP

  • Reflectivity, Distributed seismic Unix - параллельный расчет сейсмических моделей.
  • Реализовано с помощью PVM.

DOUG

  • DOUG (Domain decomposition On Unstructured Grids) - параллельный решатель для finite element - систем, возникающих из дифференциальных уравнений с частными производными эллиптического типа.
  • Библиотека реализована с помощью MPI. Протестирована на платформах SGI, SUN, SUN Solaris, IBM SP2, Intel i860 и LINUX.
  • Библиотека DOUG разработана в Department of Mathematics, University of Bath (Англия). Доступна бесплатно.

GALOPPS

  • GALOPPS (Genetic ALgorithm Optimized for Portability and Parallelism System) - библиотека "обобщенных" генетических алгоритмов. Доступна многопоточная версия.
  • Распространяется бесплатно.

JOSTLE

  • JOSTLE - библиотека для распределения расчетов на сетках (mesh partitioning software).
  • Реализована на С с помощью MPI.

NAMD

  • NAMD - параллельная объектно-ориентированная библиотека для расчетов в области молекулярной динамики.
  • Реализована на С++ с использованием шаблонов, а также Charm++ и Converse.
  • Распространяется бесплатно. Доступны исходные тексты, а также откомпилированные двоичные файлы для платформ HP-UX, SGI Origin2000, Linux/x86, Solaris/SPARC, Cray T3E.

P-Sparslib

  • PSPARSLIB (A Portable Library of Parallel Sparse Iterative Solvers) - библиотека параллельных итеративных решателей для разреженных линейных систем.

PIM

  • PIM (The Parallel Iterative Methods) - набор процедур на Фортран-77, реализующих параллельные версии различных итеративных методов решения систем линейных уравнений.
  • Платформы: сеть рабочих станций с PVM3 или MPI, SGI Challenge, Cray T3D/T3E, IBM RS/6000 SP и др.

ParMETIS

  • PARMETIS - параллельная версия библиотеки METIS, включающей ряд алгоритмов над графами (parallel graph partitioning).
  • Реализована с помощью MPI.

PARPACK

  • PARPACK (Parallel ARPACK) является параллельной версий библиотеки ARPACK (Arnoldi Package) для решения крупноразмерных задач собственных значений на Fortran 77.
  • Используются коммуникационные библиотеки BLACS и MPI.

PBLAS

  • Параллельные версии базовых процедур линейной алгебры (BLAS), уровней 1, 2, 3. Библиотека разработана в рамках проекта ScaLAPACK.

PETSc

  • Набор процедур и структур данных для параллельного решения научных задач с моделями, описываемыми в виде дифференциальных уравнений с частными производными.
  • Библиотека реализована с помощью MPI.
  • Поддерживаемые платформы: рабочие станции Sun, RS/6000 включая SP, SGI IRIX - 32-битные и 64-битные версии, HP Exemplar, Cray T3D/T3E, DEC Alpha, Linux/FreeBSD/Windows NT на Intel.
  • Библиотека разработана в Argonne National Laboratory/MCS division. Распространяется бесплатно.

PGAPack

  • PGAPACK (Parallel Genetic Algorithm Library) - библиотека параллельных генетических алгоритмов.
  • Разработана в ANL/MCS (David Levine).

PLAPACK

  • Пакет параллельных процедур линейной алгебры. Включает параллельные версии процедур решения систем линейных уравнений с помощью LU и QR-разложений, разложения Холецкого.
  • Пакет PLAPACK реализован с помощью MPI. Включает интерфейсы для языков Fortran и С.
  • Пакет PLAPACK разработан в университете шт. Техас (Austin). Доступен бесплатно.
  • Руководство пользователя было издано в издательстве MIT Press: Robert van de Geijn, "Using PLAPACK: Parallel Linear Algebra Package" (1997).

ScaLAPACK

  • Библиотека ScaLAPACK включает подмножество процедур LAPACK, переработанных для использования на MPP-компьютерах, включая: решение систем линейных уравнений, обращение матриц, ортогональные преобразования, поиск собственных значений и др.
  • Библиотека ScaLAPACK разработана с использованием PBLAS (параллельные версии BLAS уровней 1,2,3) и коммуникационной библиотеки BLACS.
  • Поддерживается на платформах IBM RS/6000 SP, Intel Paragon, SGI Origin 2000, и HP Exemplar, а также на кластерах рабочих станций. Может быть портирована на любую платформу, где поддерживается PVM или MPI.
  • ScaLAPACK - совместный проект нескольких организаций (Oak Ridge National Laboratory, Rice University, University of California at Berkeley University of California at LA University of Illinois, University of Tennessee at Knoxville)

SPRNG

  • SPRNG (Scalable Parallel Random Number Generators) - параллельная библиотека генераторов случайных чисел для методов Монте-Карло.

Другие библиотеки

Смотрите также:

© Лаборатория Параллельных Информационных Технологий, НИВЦ МГУ Rambler's Top100