На суперкомпьютере "Ломлносов" установлена программа TURBOMOLE.
Для запуска программы, предварительно, необходимо подготовить входные файлы.
Подготовка входных файлов осуществляется программой define.
Для запуска программы define необходимо определить переменную среды TURBODIR. Для этого в среде запуска задач (сервер с которого запускаются задачки) нужно выполнить команду:
export TURBODIR=/opt/TURBOMOLE
(для удобства данную команду можно записать в файл ~/.bashrc)
Там же в среде запуска задач запустить интерактивную программу define и ввести в нее нужные параметры
/opt/TURBOMOLE/bin/em64t-unknown-linux-gnu/define
Программа define создаст входные файлы для дальнейших расчетов.
Сами расчеты запускаются из той же директории, где и лежат созданные входные файлы.
Например, для мотода Хартри-Фока команда запуска расчетов такова:
sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/TURBOMOLE/run_slurm.sh dscf
для связанных кластеров:
sbatch -p hdd4 -n 16 -t 5 /opt/TURBOMOLE/run_slurm.sh ricc2
Для запуска расчетов установка MPI-окружения не требуется,
(внимание: здесь не надо указывать скрипты запуска impi или mvapich, run_slurm.sh сам себе является скриптом запуска)
